Модуль Taxonomy Orphanage позволяет удалить из объектов осиротевшие ссылки терминов. Стандартно, Друпал не удаляет из базы данных записи поля Term reference при удалении термина, который используется в этом поле.
Например, в типе документов commerce_product у вас есть поле field_product_discount_bonus, которое создаёт связь с термином из словаря discount_bonus. Если вы удалите из словаря термин, который задействован в этом поле, то в базе данных таблица field_data_field_product_discount_bonus по-прежнему будет содержать запись для удалённого термина и его tid в field_product_discount_bonus_tid. Этот модуль позволяет очистить базу данных от подобных ненужных записей.